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含脯氨酸的多肽离子的UV光解离:从分子动力学来解析

Published: 2015-12-02

Keyword: 多肽,分子动力学

含脯氨酸的多肽离子的UV光解离可产生反常的产物离子。本文中研究了含脯氨酸的多肽离子在231 nm下UV光解离(y-2)、(a + 2) 和(b + 2)反常片段离子的形成。来自于法国的研究人员报道了含脯氨酸的多肽离子的UV光解离的电子激发态的计算和分子动力学模拟,以能在理论上和实验上研究含脯氨酸的多肽离子的UV光解离的第一步。结果表明,作者研究了(y-2)、(a + 2) 和(b + 2)片段离子的通路。二次和三次激发单重态(S2 和 S3)接近于213 nm。此外,S2 和 S3激发态的非绝热的分子动力学模拟(MD)显示在脯氨酸残基附近的C-C和 C-N 键激活后S2 和 S3开始激发。分子动力学模拟表明早期的弛豫机制导致片段通路的发生。因此,作者在光片段通路的识别上给人提供了一个新的思路,从而可以研究点击激发态和片段通路本质之间的联系。